南洋行动的辉煌胜利并未让整个“锤子联盟”感到欢欣鼓舞，反而引发了内部不小的动荡。东南沿海的海域，自联盟成立以来一直由分散的各地头领负责看守。然而，随着陈煜将大部分精锐力量调往南洋，一些疏于防范的区域被明朝抓住了漏洞，逐步收复。

明军不仅恢复了对几处重要港口的控制权，还对海域贸易实施了更严密的封锁。沿海一些小型商队被迫改道，而更多商船则因惧怕明军的袭击，选择不再与联盟合