个千户所将分属辽西、燕山两镇管辖。其中辽西镇下辖30个千户所，并且还会驻扎大批辽军（至少半数需要平账），由祖大寿出任总兵官，何可纲副之。

燕山镇则下辖60个千户（卫）所，由赵率教出任总兵官，孙祖寿副之，同样也会驻扎一万五千募兵。

另外，原山海关镇和蓟镇的东路协将会合并，成为新的蓟镇。总兵由原辽镇总兵麻登云出任，由王威的儿子王世钦副之。原山海关总兵朱梅，则被调任昌镇，去替代因为天