之后的人口密度和预防轰炸考虑，都在巨城建立初期下方设置了底巢。底巢的空间很大，相当于一个地下管道城市。

不过，因为底巢连太阳都晒不到，各个巨城人口也还没有恢复到足以启用底巢。

所以，底巢往往成为了巨城藏污纳垢的地方。而由于底巢的管道过于复杂，且有部分还未完工。所以，连巨城的管理有时候都无法触及到底巢。秩序较为混乱。

根据何峰的说法，巨城内也有极大的贫富差距，巨城中心区