季会重大改革，推出有利于豪门球队的规则。

曼联也成了那一年改革前的冠军。

1999-00赛季，欧冠有了今日的雏形，32支球队参加正赛，分为八个小组，每组的前二参加第二阶段小组赛，每组前二晋级八强。

同时欧洲优胜者杯被取消，取而代之的是各国足球协会的杯赛冠军与欧冠小组赛第三出战欧洲联盟杯。

2003-04赛季起，欧足联取消了第二阶段小组赛，欧冠