随后他开始接触织田信长，并让信长做自己儿子的乌帽子亲。不过信长明显不想和元亲和平共处，在大明万历十年，也就是公元1582年，他命令织田信孝带人收拾长宗我部。

实际上这支军队的总指挥本来是明智光秀，但秀吉为了防止光秀的领地过于庞大，给信长写了一封举报信，说明智光秀手下的斋藤利三的养女石谷菜菜是长宗我部元亲的妾，斋藤利三有可能会内通长宗我部。

信长果然大怒，撤了明智光秀的