负责党务调查，由徐恩曾（黄埔4期）任处长；第2处为特务处，戴笠担任处长。

1938年9月，第2处另立门户，升格为“国民政府军事委员会调查统计局”，仍由戴笠一手掌管，内设军事情报处、党政情报处、电讯情报处、警务处、惩戒处、训练和策反处、特种及心理作战处、特种技术研究应用处。抗战中，军统特工在抗日战争时期深入沦陷区，制造针对日军的活动。

尽管是特务头子，但是对于抗日，戴笠的政治思想