系，百里无忌将其完全独立出来，置军机院，下设院令一人、院丞二人、军机参谋若干。

以品级为军衔，各地驻军最高指挥官为指挥使，最多人数为厢，辖五千余人。

凡指挥使以上者皆集中金陵府居住，授品级衔，在军机处供职，唯有发生战事，得到皇帝授命许可，方可离京带兵指挥。

品级设为正二品，初授骠骑将军，升授金吾将军，加授龙虎将军；从二品，初授镇国将军，升授定国将军，加授奉国将军；正三