控制温度从而控制吞噬II菌落的基因表达，也是基因表达调控的重要应用之一。

在第二个生物池，吞噬II菌落的另一种基因表达，以处理化学物质调整PH值为主，这和吞噬I菌落处理工业污水的方式几乎相同。

经过两次生物污水处理池的处理后，第二个污水处理池的上层水（处理池上部70%的水）矿物质和微生物的含量已经达到了饮用水的标准。可以直接进入自来水厂等供水管网，也可以排放到河流、湖泊