黑暗部分的组成还不知道，但可能是一些基本的有机物质或是由宇宙射线引发的光化学反应。

而且冥王星大气极其稀薄，地面压强只有少量微帕，大气层可能只有在冥王星靠近近日点时才是气体，所以他的大气是蓝色的；在其余的冥王星的年份中，大气层的气体凝华成固体。靠近近日点时一部分的大气可能散逸到宇宙中去，甚至可能被吸引到冥卫一上去。

冥卫一，冥卫二，一直到冥卫五，它们的上方可能都曾经存在过一定的