际舰队有着自己的指挥体系，至高智慧是撒手了，但是在两座星际要塞上还有两名高级指挥官，由他们指挥三十二艘指挥级的星际飞船，而这三十二艘指挥级的星际飞船下属还有更多的阿尔法级的星际战舰，还有更多普通的克里巡洋舰。

有一套完整的密密麻麻的指挥体系存在，所以现在至高智慧即便是撒手，即便是和共生体之神纳尔死死纠缠在一起，但是克里帝国的整个指挥体系并没有因此而崩溃，那些普通的巡洋舰不仅听从上面的指挥