，嘉靖年间，为保卫孔府孔庙，嘉靖下令迁移曲阜县城，移城卫庙。

新的曲阜城完完全全是建立在孔府之外，加之修缮孔府、孔庙，前后总计花费了朝廷数百万两经费和无数人力，单纯就崇祯年间朝廷税收的情况来看，修一个孔府，足足抵得上十年朝廷税收甚至更多。

新曲阜县城和孔府经十年时间建成，城墙高耸，外又有深深的护城河，孔府、孔庙全部都在城中，怕也就只有当今福建的郑氏老巢安平城才能比肩了。