以调任北京陆军部任科长。酒香不怕巷子深，就是这样，他还是受到袁世凯的赏识，作为军事参议，在袁世凯背后为他出谋划策。

中华民国成立后的1912年也就是民国元年，傅良佐升任袁世凯的总统府军事处处长，随即进军衔为中将，要知道这个时候若非北洋铁杆人士是不可能做到中将的。就是这一年，他开始在仕途上崭露峥嵘，同年11月，出任察哈尔副都统，第二年6月，被北洋政府召回，转到直隶省担任蓟楡镇守使及高等军事