而总公司察觉不对，于是派遣了特种部队前来关闭红后，于是故事便彻底展开了……

可是在15年后的《生化危机：终章》剧情中，蜂巢却从一座地下实验室升级成装有全公司高层的人体冷冻机构，而T病毒则从第二部中的轮椅博士亚希福特发明的，变成了最终话中的詹姆斯·马库斯发明的。

而红后的形象问题，第二部中轮椅博士曾说过红后形象是以自己的女儿安琪拉为原型，而终章中，却变成了创始人詹姆斯