地方文官接手，再由文官上报兵部。

五军都督府既不能管理武将的升迁调动，也不能插手卫所屯田和寻常操守，已经完全丧失了统管天下兵马的职能。

朱由校现在要做的，其实只是恢复祖制。

有些祖制需要唾弃，朱由校没有半点愧疚感，因为时代需要进步，同时，有些祖制则需要恢复。

五军都督府直属于皇帝，只要五军都督府的职权仍在，皇帝就拥有对地方武将的直接控制。