第九研究所更像是座城市，是屹立于崇山峻岭千万公里森林内部的城市。

这座城有几百万人，其中大概有几十万人为第九研究所服务，从下至上拼凑成了第九研究所。

在研究所内分为s、a、b、、、e、f，七大分区层次递进，其中唯有s开头的研究室才算得上是第九研究所的核心，研究的内容涉及超凡与神明。

研究所的首领为张明耀, 自由联邦第九议长。

整个自由联邦只有十四名议