司、长官司裁撤。

都转运盐使司、盐课提举司、市舶提举司并进户部，太常寺、鸿胪寺、太仆寺、光禄寺并进礼部，承宣布政使司、提刑按察使司归锦衣卫，镇国将军府、苑马寺、王府仪卫司、留守司、卫所、都指挥使司、卫指挥使司、千户所、羁縻州土官并进兵部。

另设立大学，太医院、翰林院、钦天监、国子监、武学并入其中，取消大学士，采取学位制。

大理寺改名