吏部是六部之首，相当于现在的组织部，主管官员的升迁考核，是六部里的实权部门。

而且赵南星也是东林党的头领之一，虽然东林党此时算是战败于魏忠贤的阉党，可他依旧能掌管着吏部说明其本事过人。

同时这种安排也算是朱由校牵制魏忠贤的一个颗棋子，虽然年已快入古稀，可反而越来越受重用。

当然赵南星在东林党之中算是比较务实的，而且他也更公正一些，更是此时大明朝有名的才子。