户部与北京户部并不是上下级关系，南京户部也是直接面向皇帝，有单独的应收应付额度，以及独立的银库、粮库。

在税收方面户部也做不到统一收取、调度、划拨，因为在明朝的制度下，兵部、工部也具备收取税收的权力，还互不统属。

明朝初期，按照朱元璋的意思，赋税能收实物就别收货币。他天真且愚昧的认为钱一多就容易出现贪腐，如果都不收钱，全以物易物，贪腐自然就会消减很多。<