已经发展出一套完整的宇宙观，天主教的创造主理论很难插进日本人的宇宙体系，传教士在面对掌握丰富知识的僧侣面前，便显得有点乏力。但是，质疑最多的就是：“如果天主这么善良，为何迟到现在才传来日本？如果天主这么慈悲，为何造不出不会犯罪的人类？为何善者得不到善报，而让恶人横行无忌？”等等诸如此类的问题。

本能寺之变后丰臣秀吉先后击败各个敌对势力，成为日本最强大的大名。看到日本终将属于秀吉统治之下的